mardi 20 février 2018

RESEARCH ASSISTANT POSITION

Linking individual behaviour to ecosystem properties in microscopic
predator-prey systems
Location: Roehampton University (London, UK)
Duration: Flexible, 2-5 months
Contacts: Andrea Perna (andrea.perna@roehampton.ac.uk)
Dan Perkins (daniel.perkins@roehampton.ac.uk)
Background:
Trophic  interactions,  such  as  herbivory  and  predation  play  an  important  role  in  determining  the  relative abundance of species within an ecosystem and ultimately the productivity and stability of the ecosystem itself. Small variations in the rate of prey capture and consumption by a predator  can  trigger abrupt -often dramatic-  ecological  transitions.  Can we predict the emerging properties of an ecosystem  and anticipate when transitions will occur from the simple observation of the ‘behaviour’ of individual organisms and their interactions, e.g. from the  chasing  behaviour of predators and the patterns of movement and aggregation of prey? This can be difficult in real-world ecosystems, but it becomes  manageable in artificial ecosystems comprising only a few species in a controlled environment.
Research topic:
You will take part in a research project  funded by the Royal Society and by Roehampton University  aimed at  linking  ecological  patterns  to  the  individual-level  behaviour  of  unicellular  predators  and  preys.  The project consists in characterising the behaviour and predator-prey interactions of microorganisms adapted for  several  generations  at  different  temperature  in  microscopic  artificial  ecosystems  (microcosms).  By using  digital  image  analysis  and  video-tracking  tools  developed  by  the  host  laboratory  you  will  obtain accurate  measures  of  body  size,  speed  and  patterns  of  movement  of  predators  and  of  the  spatial distribution and movement of prey.
Duties of the successful applicant:
•  Participate in running the microcosm experiments
•  Lead on microscope based data collection and imaging
•  Partake in running video-tracking software and data analysis
•  We hope to publish the work in a peer-reviewed journal; the research assistant will be a co-author
Practical details:
You will be based at Roehampton University in London. The duration is flexible, but the total salary budget is limited to ~ £3000 and is paid on an hourly basis at a rate depending on experience.
Prerequisites:
An  interest  for  the  research  topic,  together  with  good  practical  and  analytical  skills,  is  the  major prerequisite for this internship.

vendredi 16 février 2018

Offre de stage étudiant M2 (Mars à Juillet 2018)

Contrôle d’altitude chez le bourdon : les invariants optiques
Naviguer dans un environnement inconnu est une tâche aujourd’hui impossible à réaliser par un micro-robot aérien de quelques grammes, mais qui est réalisée tous les jours avec aisance par les insectes volants. Il existe donc des principes performants, basés en particulier sur des traitements  sensori-moteurs  adéquats,  qui  permettent  aux  insectes  volants  de  réaliser  des tâches  de  navigation  spatiale  avec  précision.  C'est  précisément ces  principes,  encore  peu connus, que nous voulons comprendre, modéliser, et valider en les reconstruisant à bord de micro-aéronefs.  Ce  stage  s'inscrit  alors  dans  la  continuité  d’expériences  comportementales menées  à  Marseille  depuis  2004  sur  l’abeille.  Le  dispositif  expérimental  ci-dessous  se présente sous la forme d’un tunnel dans lequel on entraînera des bourdons à naviguer pour étudier leur positionnement en fonction de différentes configurations optiques. Il conviendra alors  de  manipuler  différentes  indices  visuels  dans  le  tunnel  (flux  optique,  lignes  de perspective…) pour étudier le comportement des boudons, on cherchera ensuite à mettre en évidence leur caractère invariant au cours de leur vol.
Durée du stage : 5 à 6 mois à partir de mars 2018
Gratification : 554€/mois (taux légal)
Techniques utilisées
  Paradigme expérimental : tunnel de vol tapissé de contrastes, attraction de bourdons, manipulations optiques, décorrélation d’indices visuels.
  Caméras + reconstitution de trajectoires des bourdons,
  Marquage des boudons, élevage en ruche.
Compétences requises
  Étudiant(e) intéressé(e) par l’éthologie, l’entomologie, les apidés, et les neurosciences.
  Statistiques (descriptive, inférentielle, ANOVA…). L’utilisation du logiciel R/Rstudio serait un plus.
  Des compétences en informatique/programmation. L’utilisation dulogiciel Matlab serait un plus.

Merci d’envoyer un CV et une lettre de motivation à :
Julien SERRES julien.serres@univ-amu.fr
Equipe Biorobotique, www.biorobotique.fr, Marseille.
Institut des Sciences du Mouvement, www.ism.univ-amu.fr, CNRS/Aix-Marseille Université.
Publications récentes
Portelli, G., Serres, J. R., &Ruffier, F. (2017). Altitude control in honeybees: joint visionbased learning and guidance. Scientific reports, 7(1), 9231. (open access)
Serres, J. R., & Ruffier, F. (2017). Optic flow-based collision-free strategies: From insects to
robots. Arthropod structure & development, 46(5), 703-717. (open access)

Offre de thèse/ PhD thesis offer

Un sujet de thèse sur le  comportement et le  chant des oiseaux est proposé dans l’équipe de Thierry Aubin (NeuroPsi UMR 9197, Université Paris-Sud, Orsay, France) et dans l’équipe de Manfred Gahr (Institut d’Ornithologie Max Planck, Seewiesen, Allemagne)  (Encadrants :  Thierry Aubin & Fanny Rybak – NeuroPsi, Manfred Gahr - Max Planck Institute).
A PhD thesis position on bird song and behaviour is open in the team of Thierry Aubin (NeuroPsi UMR 9197, University Paris-Sud, Orsay, France) and in the team of Manfred Gahr (Max Planck Institute for Ornithology, Seewiesen, Germany)  (Supervisors: Thierry Aubin & Fanny Rybak  –  NeuroPsi, Manfred Gahr - Max Planck Institute).
Etude  du  chant  et  du  comportement  territorial  de  rouges-gorges  mâles  et  femelles   (Erithacus
rubecula) durant et hors période de reproduction.
Chez les oiseaux chanteurs (Oscines), les chants sont appris et émis pendant la saison de reproduction
par les mâles, afin d’attirer des femelles et repousser des mâles rivaux. L’apprentissage et le rythme de  production  de  ces  vocalisations  sont  sous  le  contrôle  de  processus  hormonaux  et  centraux sexuellement dimorphiques. Toutefois, chez des espèces tropicales, les femelles chantent également et certaines espèces chantent et défendent un territoire toute l’année.
Le rouge-gorge (Erithacus rubecula) est un rare exemple d’espèce de région tempérée présentant ces spécificités: mâles et femelles chantent et défendent leurs territoires toute l’année. Les objectifs du projet seront 1) de comparer les structures des chants mâles et femelles enregistrés durant et hors période  de  reproduction;  2)  de  tester  par  expériences  de  playback  en  milieu  naturel   la  valeur réactogène et la fonction des chants mâles et femelles pendant et hors période de reproduction; 3) d’étudier  l’évolution  des taux  de  testostérone  plasmatique  et  la  structure  des noyaux  centraux  du chant  pendant et  hors  période  de  reproduction  chez  les mâles  et  les  femelles.  Ce  projet ouvre  de nouvelles  perspectives  sur  des  phénomènes  encore  peu  étudiées,  à  savoir  la  fonction  des  chants femelles et la nature des contrôles hormonaux et neuronaux impliqués. Cette thèse pluridisciplinaire sera effectuée sur des populations naturelles sur le campus Orsay-Gif, et sur des populations captives au Max-Planck Institut de Seewiesen.
Study of song and territorial behavior of male and female robins (Erithacus rubecula) during  and out of the breeding season.
In songbirds (Oscines), songs are learned and emitted during the breeding season by males to attract females  and  repel  other  males.  Learning  and  rates  of  emission  of  these  vocalizations  are under  hormonal and neuronal control processes which are sexually dimorphic. However, in tropical species, females may also produce songs and defend a territory year round.
The European robin (Erithacus rubecula) is a rare example of species in temperate areas that fulfils these specificities: both sexes sing and defend territories all year round. The aims of the project will be 1) to compare the acoustic structures of male and female songs recorded during  breeding and nonbreeding seasons; 2) to test in the field by playback experiments the function of male and female songs during  breeding  and  non-breeding  periods;  3)  to  study  in  both  sexes  the  variation  of  plasmatic testosterone levels and of song nuclei during the breeding and non-breeding seasons. This project opens new perspectives concerning two poorly studied phenomena: the function of female songs and the nature of hormonal and neuronal controls involved in their production. This multidisciplinary thesis will be carried out on wild populations at the Orsay-Gif campus and on captive populations at the MaxPlanck Institut of Seewiesen, Germany.
Les  candidats, issus  d’un master d’éthologie, ou de neurosciences, ou d’éco-éthologie, ou d’écologie
devront  avoir le goût à la fois de l'expérimentation sur le terrain et de  l'analyse en laboratoire de données  de  nature  acoustique,  biochimique  et   neurophysiologique.  De  solides   connaissances  en étho-écologie sont vivement souhaitées pour l’aspect travail sur le terrain.
The candidates, from masters of ethology, or neurosciences, or eco-ethology, or ecology, should have
interest and skills both for field-experiment and for lab work such as analyzing acoustic, biochemical,
neurophysiological data. A strong knowledge in etho-ecology would be highly appreciated,  for working in the field.
SVP, envoyez vos candidatures à Thierry Aubin (Thierry.aubin@u-psud.fr) avant le 31 Mars 2018.
Le projet sera défendu auprès de l’Ecole Doctorale BioSignes (Université Paris-Saclay) en juin 2018 et commencera en septembre 2018.
Please, send application  to  Thierry Aubin (Thierry.aubin@u-psud.fr)  before the 31st of March 2018. The PhD project will be defended in front of the doctoral school BioSignes (University Paris-Saclay) in June 2018, and shall start in September 2018.

jeudi 15 février 2018

Research Technician, Bristol Veterinary School - SUPP103878

The vacancy of Research Technician, Bristol Veterinary School - SUPP103878 has now gone live on the University's jobs website at www.bristol.ac.uk/jobs and will shortly be live on www.jobs.ac.uk and any other external media requested.

Link to UoB advert:
http://www.bristol.ac.uk/jobs/find/details.html?nPostingId=7158&nPostingTargetId=51816&id=Q50FK026203F3VBQBV7V77V83&LG=UK&mask=uobext


Remember to also promote your vacancy through any professional, subject-related or work-based networks that you or colleagues are members of - whether through social media such as Linkedin, Twitter or Facebook; subject or profession related blogs, web sites, newsletters and e-mail alerts; or the more traditional face-to-face contact at meetings and conferences etc. Informal and word of mouth promotion to targeted groups is an effective and no-cost way of widening your pool of suitable candidates.

Full details of the post can be accessed from your eRecruit homepage. Guidance on using eRecruit can be found at: www.bristol.ac.uk/hr/resourcing/erecruit

Two 4-year PhD positions at the University of Groningen, the Netherlands

Project 1- Behavioural ecology & evolution: the role of phenotypic plasticity in species divergence
The Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences (GELIFES) offers an NWO-funded PhD position for a research project on the role of phenotypic plasticity in speciation, using African cichlid fish as a model system.
Project description
Phenotypic plasticity is a key determinant of organismal performance, allowing rapid adjustment to environmental variation. In this project, we aim to investigate plasticity’s role in species divergence. On the one hand, plasticity may promote evolutionary differentiation by facilitating range expansion. On the other hand, plastic responses will weaken selection for genetic change, hampering adaptive evolution.
We study the role of visual plasticity in the evolution of cichlid fish species diversity. Variation in colour vision, among individuals, populations and species, is determined by both genetic factors and phenotypic plasticity. Since visually mediated behaviours influence both mating behaviour and ecological performance in cichlids, plasticity in colour vision could be important in divergent evolution. The PhD student will conduct experiments and analyses addressing the consequences of visual plasticity for both 1) macro-evolutionary processes and 2) individual behaviour and fitness. Approaches include behavioural experiments, molecular analysis of visual pigments (sequencing, qPCR, HPLC) and phylogenetic comparative analyses.
The project is a collaboration between Dr Martine Maan, Prof dr Rampal Etienne and Dr Louis van der Zande. The PhD student will join a lively and international team of researchers and (PhD) students working on (cichlid) behavioural ecology and evolution, supported by laboratory technicians and animal caretakers.
Qualifications
We are looking for an enthusiastic and talented PhD candidate with a master's degree (or equivalent) in Biology, preferably with a strong interest in behavioural ecology, evolution and biodiversity. The ideal candidate has experience with behavioural observation, animal handling and molecular genetics techniques. We also ask for a collaborative mindset, and excellent communication and writing skills (also in English). Other helpful competences include statistical proficiency (e.g. in the R software environment), possession of a driving licence, and a license to perform animal experiments (art. 9 Wet op de dierproeven (the Dutch Experiments on Animal Act)) or the willingness to obtain these.
For more information and application procedure, see:
Project 2 - Biology & philosophy: inheritance of acquired characters
The Young Academy of Groningen (YAG) was established in 2016 to bring together young researchers from diverse academic backgrounds. The YAG stimulates interdisciplinary research, contributes to internationalization and science policy, and promotes public outreach. We offer an interdisciplinary PhD scholarship for a project at the interface of biology and philosophy.

Project description
How do living organisms transmit their characteristics to the next generation? The textbook answer is: by passing on their DNA, which encodes all heritable traits. In recent years, however, biologists have discovered that this is not the whole story. Evidence is accumulating that environmental influences during the lifetime of an individual, such as nutrition or stress, can influence the phenotype of their progeny across several generations. This phenomenon reminds us of the concept of ‘inheritance of acquired characters’, already formulated in 1809 by the French naturalist Jean Baptiste de Lamarck in his Philosophie Zoologique. Lamarck’s ideas have often met with skepticism, but recent developments in molecular genetics have inspired a re-evaluation of his legacy. Indeed, we seem to witness a renaissance of Lamarckian thought.
In this project, we aim to explore the Lamarckian nature of recent discoveries in the transmission of inherited traits, and in this way to explore what modern biology can, or cannot, learn from the original ideas of Lamarck, whether or not the works of Lamarck offer lessons that change the way we think about evolution. This project will contribute to that debate by bringing together the disciplines of evolutionary biology, and the history of science and philosophy.
The project is a collaboration between Dr. Martine Maan (www.rug.nl/staff/m.e.maan) and Dr. Han Thomas Adriaenssen (www.rug.nl/staff/h.t.adriaenssen). 
Qualifications
The ideal candidate has a background in both biology and the history of science or philosophy. Alternatively, the candidate will have a background in one of these disciplines, and be prepared to be trained in the other as a part of their PhD trajectory. 
For more information and application procedure, see:

mercredi 14 février 2018

Offre de stage étudiant: Oceans Research Mossel Bay, Afrique du Sud

Oceans Campus offre aux étudiants de premier cycle de tous niveaux la possibilité de devenir membre de l'Unité Oceans Research à Mossel Bay en Afrique du Sud.  
Oceans Research est le seul véritable institut de recherche qui collabore avec de nombreuses universités sud-africaines et internationales.
 
Nous offrons une occasion unique aux étudiants d'acquérir de l'expérience et une formation pratique en dirigeant des recherches sur la mégafaune marine d'Afrique du Sud, y compris le grand requin blanc. Les stagiaires se joignent à nos scientifiques chaque jour dans leurs expéditions pour mener des recherches et des expériences novatrices impliquant les requins de Mossel Bay et les mammifères marins. 
Les étudiants ne sont pas seulement des observateurs, mais ils contribuent à la recherche, recueillent des données réelles, des informations précieuses, se forment avec les dernières techniques de recherche océanographique leur permettant d'acquérir les compétences nécessaires pour devenir de bon biologiste marin.
 
Si vous pensez que cette opportunité peut intéresser vos étudiants et leur être bénéfique. Merci de leur transmettre cette information et je serais heureuse de leur fournir de plus amples informations.
 
http://african-campus.com/programs/
 
PS: Il est recommandé que les étudiants aient une bonne compréhension de l’anglais pour participer car toute la communication se fera en anglais.
N’hésitez pas à me contacter pour plus de renseignements.